农学基础实验室始建于2010年，由植物生理室、植物病理室、有害生物综合治理室、昆虫室、农业微生物室和植物标本室等7个分室组成，总面积412.11平方米，仪器设备总值168.45万元。实验室主要承担农学专业《植物学》、《植物生理学》、《生物化学》、《植物病理学》、《农业昆虫学》、《作物育种学》、《微生物学》、《仪器分析》和《插花艺术》等课程的实验教学及相关开放实验任务，其中课程实验项目开出率100%，为专业应用型人才培养目标的达成提供了重要保障。
在完成实验教学任务的同时，实验室还服务于教师科学研究、大学生科研项目和学生毕业论文试验等。近年来开展自治区级科研项目4项，市级项目1项，院级科研项目2项，校企合作项目1项，大学生科研项目2项，较好地体现了本实验室的功能。2017年该实验室与作物生产实验室合并获批内蒙古自治区实验教学示范中心。
