河套学院医学系现共有专任教师62人，其中博士3人，硕士27人；高级职称12人，中级职称32人。1人被评为自治区级教学名师，1人被评为自治区级教坛新秀，1人被评为“草原英才”“河套英才”全市“最美科技工作者”，1人被评为校级教坛新秀；两门课程被评为自治区级精品课程，2个专业被评为自治区级品牌专业；获批自治区级实验示范中心以及自治区级教学团队，拥有内蒙古自治区重点实验室。
2019年巴彦淖尔市医院成为河套学院临床医学院。我系教师在每学期末都要深入到临床一线进行学习，以实现教学与临床的零距离对接。同时在课程教学中特聘请医疗行业专家为学生进行理论与实践的教学指导，并且部分实训实践课程直接在医院完成，以实现对学生的应用型、实践型培养。
